Enzym dekapujący pasożytniczych eukariontów ma nietypowe właściwości
19 04 2026
ALPH1 to nietypowy enzym wykorzystywany przez świdrowce do usuwania czapeczki mRNA (zamiast typowego dla eukariontów enzymu dekapującego, Dcp2). Badamy ALPH1 Trypanosoma brucei jako potencjalny cel dla leków przeciwpasożytniczych, które mogłyby pomóc w walce ze śpiączką afrykańską, chorobą Chagasa, a także leiszmaniozą (wywoływaną przez pokrewne pasożyty z rodzaju Leishmania).
W niniejszej pracy opisaliśmy aktywność enzymatyczną ALPH1 przy użyciu kilku ortogonalnych testów aktywności i doszliśmy do zaskakujących wniosków:
- ALPH1 preferuje RNA bez metylacji m7G, pomimo silnej metylacji mRNA trypanosomów (kap 4)
- Cięcie nukleolityczne przez ALPH1 prowadzi do powstania ppRNA (podczas gdy Dcp2 wytwarza pRNA, tzn. z 5’ monofosforanem).
- Domena C-końcowa ALPH1 jest niezbędna in vivo i zwiększa aktywność dekapowania in vitro.
Podsumowując, ALPH1 zachowuje pewne cechy swojego bakteryjnego homologu ApaH. ALPH1 prawdopodobnie zamienia wydajność enzymatyczną na dodatkowe zdolności regulacyjne, aby działać na eukariotycznych substratach mRNA.
Praca ta została wykonana w ramach trójstronnego projektu WEAVE finansowanego przez DFG/GACR/NCN:
Narodowe Centrum Nauki [WEAVE UNISONO grant 22022/04/Y/NZ1/00114 dla MWG]
Deutsche Forschungsgemeinschaft [KR4017/12-1 dla SK], GACR [24-14298L dla MZ]
L. Pereira, D. A. Dzadz, P. A. C. Londoño, M. Warmiński, J. Kowalska, N. Seifert, S. Braune, F. Holetz, M. Zoltner, S. Kramer, M. W. Górna
The trypanosome mRNA decapping enzyme ALPH1 prefers caps without m7G methylation and produces diphosphate RNA
Nucleic Acids Research, Volume 54, Issue 6, gkag322
https://doi.org/10.1093/nar/gkag322
