Laboratorium Modelowania Procesów Komórkowych
Kierownik zespołu: dr hab. Dorota Latek
Adres e-mail Kierownika: dlatek@chem.uw.edu.pl
Krótki opis tematyki badawczej:
Zespół badawczy jest ukierunkowany na kilka najnowocześniejszych obszarów zainteresowania, które są zgodne z nowoczesnymi wyzwaniami i aktualnymi możliwościami. Obejmują one uczenie maszynowe i sztuczną inteligencję, szczególnie w kontekście aplikacji internetowych projektowanych w celu ulepszenia przetwarzania danych biochemicznych i analiz predykcyjnych. Wykorzystując algorytmy ML i platformy oparte na chmurze, zespół zwiększa dostępność i skalowalność różnych narzędzi cheminformatycznych. Te innowacje nie tylko ułatwiają projektowanie nowych kandydatów na leki, ale także umożliwiają szybką iterację i udoskonalanie modeli molekularnych różnych białkowych celów dla leków. Synergia między ramami obliczeniowymi a technologiami internetowymi zapewnia, że ogromna ilość generowanych danych może być efektywnie udostępniana i analizowana, przyspieszając postęp w medycynie. Ponadto, opracowane bazy danych ze strukturami białek i danymi cheminformatycznymi odgrywają istotną rolę w odkrywaniu nowych leków, ze szczególnym uwzględnieniem ukierunkowania na receptory sprzężone z białkiem G (GPCR). Zespół ma na celu m.in. badanie mechanizmów aktywacji receptora GPCR, wykrycie ważnych makro- i mikroprzełączników aktywacji, tak aby lepiej zrozumieć selektywność funkcjonalną i interakcje receptorów z białkami efektorowymi. Badania te mają implikacje dla rozwoju leków przeciwnowotworowych i przeciwwirusowych, a także leczenia przewlekłych i ostrych stanów zapalnych.
Dodatkowe obszary zainteresowań obejmują endokrynologię i metabolizm, ze szczególnym uwzględnieniem cukrzycy typu 2, oraz dynamiki układu odpornościowego poprzez badanie receptorów tego układu, m.in. receptorów chemotaktycznych układu dopełniacza. Wysiłki te są ukierunkowane na rozwiązywanie problemów związanych z transplantacją i odrzucaniem przeszczepów allogenicznych, mając na celu opracowanie zaawansowanych terapii przeciwzapalnych.
Kompleksowe podejście interdyscyplinarne zespołu zapewnia, że realizowane tematy w sposób innowacyjny wspierają współpracę w wielu dziedzinach w celu osiągnięcia znaczących wyników. Aby uzupełnić swoje podejścia obliczeniowe i teoretyczne, zespół badawczy podkreśla znaczenie walidacji eksperymentalnej w projektowaniu leków. Testy funkcjonalne, testy wiązania i inne metody in vitro są stosowane we współpracy z innymi grupami badawczymi w celu potwierdzenia hipotez wyprowadzonych z analizy danych biochemicznych i farmakologicznych. Testy te są kluczowe dla weryfikacji aktywności zaprojektowanych związków, oceny ich interakcji z receptorami GPCR i optymalizacji kandydatów na leki. Dzięki rygorystycznym ramom eksperymentalnym zespół łączy przewidywania obliczeniowe i zastosowania w świecie rzeczywistym, zapewniając, że badania w zakresie odkrywania leków przekładają się na skuteczne rozwiązania medyczne.