Grupa Modelowania Gęstości Elektronowej
Kierownik zespołu: prof. dr hab. Paulina Dominiak
Adres e-mail Kierownika: pdomin@chem.uw.edu.pl
Krótki opis tematyki badawczej:
Nasza grupa opracowuje nowe metody modelowania gęstości elektronowej, które mają zastosowanie w krystalografii rentgenowskiej i elektronowej, chemii i biologii strukturalnej.
Naszym głównym celem jest opracowanie metod, które dostarczają więcej informacji z rutynowych danych dyfrakcji rentgenowskiej i wspierają analizę danych dyfrakcji elektronowej. Z jednej strony metody te mają na celu poprawę jakości danych geometrycznych już uzyskanych z tego typu pomiarów, a z drugiej strony mają na celu zapewnienie dostępu do nowych typów informacji, tj. do gęstości elektronowej, potencjału elektrostatycznego i energii oddziaływań. Naszym zamiarem jest, aby opracowane przez nas metody modelowania gęstości elektronowej i szacowania energii oddziaływań międzycząsteczkowych wypełniły przestrzeń między metodami mechaniki klasycznej (pola siłowe) a metodami mechaniki kwantowej.
Opracowane przez nas metody są stosowane w praktyce (zarówno w eksperymencie, jak i w teorii) w celu zrozumienia roli oddziaływań międzycząsteczkowych w kompleksach białek i kwasów nukleinowych, a także w kryształach związków organicznych. Skupiamy się w szczególności na znaczeniu oddziaływań elektrostatycznych. Interesuje nas związek oddziaływań międzycząsteczkowych z architekturą kryształów, strukturą makrocząsteczek lub procesem rozpoznawania molekularnego w kontekście projektowania leków.